В июне 1945 года создан «Ленгипрогаз» (до 1974 года), далее «Ленгипронефтехим» для практического решения задач по проектированию и строительству системы газообеспечения послевоенного Ленинграда.

Всего три года понадобилось институту и другим задействованным для этой цели проектным и строительным организациям, чтобы в октябре 1948 года осуществить ввод в действие первого промышленного блока камерных печей на заводе в городе Кохтла-Ярве и магистрального газопровода Кохтла-Ярве - Ленинград, который стал первым в мире газопроводом по передаче искусственного сланцевого газа на большие расстояния.

К концу 40-х и началу 50-х годов прошлого столетия относится коренной поворот в жизни института - переход на проектирование объектов по переработке нефти: технологических установок и нефтеперерабатывающих заводов. С середины 50-х годов институт стал ведущим в области процессов облагораживания углеводородов - катализата риформинга.

По проекту института в 1952 году сдан в эксплуатацию газосланцевый завод в городе Сланцы Ленинградской области. На заводе построены: газогенераторная станция, оборудованная 36-ю генераторами шахтного типа, три блока камерных печей, узлы очистки бытового газа, многочисленные объекты общезаводского хозяйства. Участие в строительстве и освоении сланцеперерабатывающих предприятий показали, что коллектив института способен самостоятельно решать сложные задачи на высоком инженерном уровне. В связи с этим, Постановлением Совета Министров СССР от 29 сентября 1951г. «Ленгипрогаз» был выделен из состава «Гипрогазтопрома» в самостоятельный институт с отнесением его к ведущим проектным организациям первой группы и подчинением непосредственно Министерству нефтяной промышленности.

В 1954 году по проекту «Ленгипрогаза» на Краснодарском НПЗ построена первая отечественная установка каталитического риформинга на платиновом катализаторе.

Повышенная потребность в нефтепродуктах на Северо-Западе нашей страны продиктовала необходимость сооружения нефтеперерабатывающего завода в этом регионе. «Ленгипрогаз» стал генеральным проектировщиком нового НПЗ. Из многих возможных точек была выбрана площадка в городе Кириши. Строительство завода началось в 1960 году. Проектом завода предусматривалась выработка продукции, соответствующей мировым стандартам. Киришский НПЗ обладал наилучшими показателями среди заводов второго поколения, строившихся в 1955-1970 гг. Вклад института в строительство и развитие Киришского НПЗ неоднократно отмечался правительственными наградами, медалями ВДНХ, почетными дипломами и грамотами Совета Министров СССР, Госстроя СССР.

Менее 20 лет понадобилось институту, чтобы выйти на международный рынок. Осуществлялось проектирование отдельных технологических установок для зарубежных стран: Болгарии, Венгрии, КНДР, Индии, Эфиопии, Турции, Югославии, Кубы. Эти установки были построены и введены в эксплуатацию в период 1964-1987 гг. и до настоящего времени успешно эксплуатируются.
В 1964 году институтом начато проектирование первенца Белорусской нефтепереработки - Полоцкого (позднее Новополоцкого) нефтеперерабатывающего завода.

В период 60-х и 70-х годов прошлого века институт явился инициатором и создателем проектов крупнотоннажных комбинированных систем по комплексной переработке нефти типа ЛК-6У. Комбинированные системы типа ЛК-6У мощностью от 6 до 8 млн. тонн нефти в год, в количестве восьми технологических установок были построены и успешно эксплуатируются в России, в странах СНГ и Балтии.

В 1974 году «Ленгипрогаз» переименован в Ленинградский государственный институт по проектированию предприятий нефтеперерабатывающей и нефтехимической промышленности – «Ленгипронефтехим».

В начале августа 1975 года введена в эксплуатацию первая комбинированная установка системы ЛК-6У на Мозырском НПЗ. В 1978 году сданы в эксплуатацию системы ЛК-6У на Кременчугском, Павлодарском и Мозырском (вторая) НПЗ. Две системы ЛК-6У построены на Мажейкском НПЗ (1980 и 1983гг.), по одной - на Ачинском (1983г.) и Чимкентском (1985г.).

Работы по проектированию Киришского НПЗ не прекращаются в «Ленгипронефтехиме» ни на один день. Начиная с 1989 года проектируется комплекс по производству ЛАБ/ЛАБС на базе технологии дегидрирования парафинов для получения моноолефинов и последующего алкилирования бензолом по лицензии фирмы «UOP» и осуществляемой фирмой «Panador». Комплекс введен в эксплуатацию в 1996 году.

В 1995 году, в соответствии с планами приватизации институт был преобразован в акционерное общество открытого типа АООТ «Ленгипронефтехим», а в июне 2000 года в открытое акционерное общество ОАО «Ленгипронефтехим».

С 2000х годов, как у нас в стране, так и за рубежом имя ООО «Ленгипронефтехим» приобретает репутацию основной ведущей проектной организации в области нефтегазопереработки и нефтегазохимии на территории Российской Федерации, выполняющей проекты с самым высоким качеством. В этой связи существенно расширяется круг Заказчиков института. Вводятся в эксплуатацию новые объекты по проектам, выполненным коллективом ООО «Ленгипронефтехим»: в 2012г. - Установка гидродепарафинизации смеси атмосферного газойля с бензином висбрекинга (Л-24-10/2000) в составе завода глубокой переработки нефти ООО «КИНЕФ»; в 2013г. - объекты Пускового комплекса завода глубокой переработки нефти в составе ООО «КИНЕФ»; в 2015г. - комплекс установки низкотемпературной изомеризации Изомалк-2-ЛИН-800 в АО «РНПК» (Рязанский НПЗ); в 2018 году - Комплекс производства высокооктановых компонентов бензина в составе ООО «КИНЕФ». Данное достижение отмечено Почетным дипломом Губернатора Ленинградской области А.Дрозденко коллективу ООО «Ленгипронефтехим». В 2019 году на ПАО «Татнефть» им. В.Д. Шашина введен в эксплуатацию «Комплекс нефтеперерабатывающих и нефтехимических заводов. Объекты, предназначенные для получения автомобильных бензинов и индивидуальных ароматических углеводородов», позволивший начать производство высококачественного бензина марок АИ-92, АИ-95, АИ-98 и АИ-100 на предприятии АО «ТАНЕКО». Данное достижение отмечено грамотами, благодарностями ПАО «Татнефть» и благодарностью Президента Республики Татарстан. В период 2020-2021 годов благодаря проекту ООО «Ленгипронефтехим» «Строительство новой печи для нагрева вакуумного газойля в цехе № 01 КГПТО» для АО «ТАИФ-НК» был успешно запущен Комплекс глубокой переработки тяжелых остатков, что отмечено в благодарственном письме Заказчика коллективу института; В 2021 году на Яйском НПЗ успешно введена в эксплуатацию комбинированная установка переработки прямогонных бензиновых фракций УК-1, проектирование которой так же выполнил коллектив ООО «Ленгипронефтехим». Данный проект позволил предприятию начать выпуск высококачественных автобензинов и был отмечен медалью «За бизнес во имя создания» от Губернатора Кемеровской области.

С февраля 2005 года - институт входит в состав нефтяной компании ПАО «Сургутнефтегаз», и приобретает статус общества с ограниченной ответственностью, сокращенно ООО «Ленгипронефтехим».

В 2016г. совместный проект ООО «Ленгипронефтехим» и ООО «НП Нефтехим» «Создание отечественной технологии каталитического риформинга с непрерывной регенерацией катализатора для производства высококачественных автобензинов» стал победителем конкурса фонда «Сколково» и получил статус национального проекта Минэнерго России.

В период с 2018 по 2022 годы коллективом ООО «Ленгипронефтехим» была разработана первая отечественная технология каталитического риформинга с непрерывной регенерацией катализатора по которой получены 6 патентов в Российской Федерации, 4 зарубежных заявки РСТ и уже начато строительство соответствующей установки на Ильском НПЗ.